Rapp. Comm. int. Mer Médit., 37,2004
92
PRELIMINARY EXPERIMENTS TOWARDS CONTROLLING BIOFOULING EFFECTS 
ON THE M3A ARRAY’S OPTICAL INSTRUMENTS 
Panos Drakopoulos
1
, Vassilis Zervakis
2
, Giannis Thanos
2
, Kostas Nittis
2*
Panos Renieris
2
, Gianna Assimakopoulou
2
and Christos Tziavos
2
1
Laboratory of Optical Instrumentation, Technological Educational Institute (TEI) of Athens, Greece
2
Dep. of Oceanography, Hellenic Center for Marine Research, Anavissos, Greece
Abstract
For the needs of the EU MFSTEP project, and based on the experience gathered during its previous phase, various experiments have been
planned to prevent biofouling of the optical instruments on the Mediterranean Moored Multi-sensor Array (M3A). Although the system,
when operational, is deployed in oligotrophic open sea waters 22 N.M. north of the port of Iraklion Crete, severe fouling prevented the
proper functioning of the optical sensors and sources after 30 days of deployment. These experiments are still underway, however,
emerging initial results from a 50 day deployment in coastal waters, indicate that the introduction of a bromine canister and copper tubing
in the ?ow system can result in almost fouling free instruments. 
Keywords: marine optics, marine growth, operational oceanography, optical oceanography
Introduction
New trends in ocean observation approaches demand the
deployment of moored instruments for large periods of time.
Important processes such as ecological can be monitored by sensing
various properties of the visible light field within the water column
(both inherent and apparent). This is accomplished by means of
optical sensors and sources, which however, tend to be severely
affected by marine biofouling [1]. Such problem was encountered
during the first stage of the Mediterranean Forecasting System project
(MFS-PP) [2], and in particular for the optical instruments attached on
the M3A array [3]. Thus, for the second phase of MFS, the MFSTEP,
a special task was introduced in order to assess and mitigate this
negative aspect. 
Data and methods
The location of the experimental deployment was the protected
surroundings of a fish-farm situated off the islet of Patroklos in
Saronikos Gulf, Greece. It was chosen so having in mind the
minimization of the deployment period since the waste of the farm
results in relatively eutrophic waters.
The instruments deployed were four SBE-16s having the following
optical sensors attached: 
1. PAR sensors (model 193SA manufactured by LI-COR). 
2. Fluorometers (WETSTAR by Wetlabs)
3. Transmissometers (C-star by Wetlabs) at 660 nm with a 25 cm
path length.
In the current configuration, the PAR sensors are open (to the
surrounding water column) while the ?uorometers and transmisso-
meters are closed by means of tubing and pump. 
The experiment was set as follows: For the open instruments no
particular action to prevent biofouling was taken. For the rest of the
sensors four different configurations were deployed (no protection,
copper, bromine, combination of both). The copper configuration
simply included replacement of 10 cm of plastic tubing adjacent to the
?uorometer and transmissometer with copper tubing (
Ø
10 mm) of
similar length. The bromine system included a vented canister, [4],
with bromine tablets attached between the ?uorometer and the
transmissometer and above them, in order to slowly and constantly
release bromine solution through diffusion towards both sensors. To
avoid erroneous readings all sensors were ?ushed for 15 seconds prior
to taking a measurement. The sampling interval was set to 1 h.
For the ?uorometers, both pre-deployment and post-deployment
calibration was performed. It was based on five samples of local
phytoplankton populations which were nutrient-enriched and cultured
for about 10 days to attain discrete chl-a concentration values. After a
15 minute sampling by the ?uorescence sensors, a reference value was
estimated by extracting phytoplankton by means of filtering and
measuring its chl-
a
concentration with a TURNER AU-10 laboratory
?uorometer.
Transmissometers were post deployment calibrated by obtaining
several voltage readings after blocking the receiver to obtain (v
dark
)
and in de-ionized water to obtain a clean water offset (v
ref
).
Results and discussion
The instruments were recovered after 50 days of deployment when
scuba divers observed excessive external biofouling build up. 
Inter comparison of PAR and incoming solar radiation time series
after the removal of the daily cycle, showed a decrease of sensitivity
in the order of 40% in 50 days with an accelerating trend towards the
end of the deployment period.
The ?uormeters recorded no obvious increase in chlorophyll-
a
concentration despite there external build up of organisms. Only the
one with no antifoulant protection showed an increasing trend towards
the end of the deployment. It should be noted here that the
concentration as measured from bottle data was low and ranged from
0.06 to 0.09 
µ
g/lt.
The transmissometers’records exhibited an exponential increase in
all configurations with no bromine canister, indicative of optical
window contamination. The one with the least bio-fouling was that
which incorporated both copper tubing and bromine solution (see
Figure 1). This was in contrast to the results reported elsewhere [1],
where copper alone was sufficient.
Fig. 1. Time series of c(660) (m
-1
) beam attenuation coefficients for two
characteristic configurations. Solid line corresponds to the one with
bromine canister and copper tubing and the dashed line to that with only
copper tubing.
A follow up experiment is planned either with a longer deployment
period or during the spring bloom, so a better assessment of the
fouling conditions on the fluorometers is achieved. Moreover
additional steps will be taken towards protecting the open PAR
instruments (i.e. copper collars). 
References
1-Manov D.V., Chang G.C., Dickey T.D. 2003. Methods for reducing
biofouling of moored optical sensors. Unpublished manuscript.
2-Drakopoulos P.G., Petihakis G., Valavanis V., Nittis K., Triantafyllou
G., 2003. Optical variability associated with phytoplankton dynamics in
the Cretan Sea during 2000 and 2001. “Building European Capacity in
Operational Oceanography - Proceedings of the Third International
Conference on EuroGOOS”, in press.
3-Nittis K., Tziavos C., Thanos I., Drakopoulos P., Cardin V., Gacic M.,
Petihakis G., Basana R 2003. The Mediterranean-Moored Multi-sensor
Array (M3A): system development and initial results. Ann. Geophysicae,
21: 75-87.
4-Davis R.F., Moore C.C., Zaneveld J.R.V., Napp J.M., 1997. Reducing
the effects of fouling on chlorophyll estimates derived from long-term
deployments of optical instruments. J. Geophys. Res. 102: 5851-5855.