Rapp. Comm. int. Mer Médit., 37,2004

120

MEDATLAS 2002: DATABASE AND DATA MANAGEMENT SYSTEM FOR THE LONG TERM MONITORING

OF MEDITERRANEAN AND BLACK SEAS

C. Maillard

1*

, E. Balopoulos

2

, N. Mikhailov

3

, M. Fichaut

1

, G. Maudire

1

, M-J. Garcia

4

, B. Manca

5

, A. Giorgetti

5

, 

A. Iona

2

, M. Rixen

6

, and The Medar Group

1

IFREMER, Centre de Brest, BP 70, 29280 Plouzané, France - * Catherine.Maillard@ifremer.fr.

2

HCMR, P.O. Box 712, 190 13 Anavyssos, Greece - efstathios.balopoulos@hnodc.ncmr.gr.

3

RIHMI-WDC, Kaluga Region, Obninsk 024020, Russia - nodc@meteo.ru.

4

IEO, c. Corazon de Maria 8, Madrid, Spain -  MJesus.garcia@md.ieo.es.

5

OGS, Borgo Grotta Gigante, Trieste 34010, Italy - manca@ogs.trieste.it.

6

GHER, Univ. de Liege, BE4000, Liege, Belgium - M.Rixen@ulg.ac.be.

Abstract

The EU concerted action MEDAR/MEDATLAS-II, was launched in 1998 with the overall objective to make available a comprehensive

data product of multi-disciplinary in-situ data and information in the Mediterranean and Black Sea, through a wide co-operation of the

bordering countries. The resulting integrated multidisciplinary database MEDATLAS 2002 includes observed data collected over more

than one century and gridded climatological fields and maps. This database has been published on CDrom to facilitate its use. New actions

are in preparation to improve the data services by offering an integrated and continuously updated data access on internet. 

Key words: Mediterranean, Black Sea, Oceanography, Chemicals, Database

Introduction

Long time series of marine observations are required for many

studies, especially to follow up changes in the seawaters, to manage

living and non-living marine resources and to make predictions. Many

scientific laboratories collect such data, but in most cases they remain

dispersed in heterogeneous formats and systems. Their access is

difficult, and due the lack of appropriate archiving, they are frequently

in danger to be lost. The IOC “Global Ocean Data Archaeology and

Rescue (GODAR)” programme has been launched to rescue and

disseminate the dispersed data. Two pilot projects MODB and

MEDATLAS (1994-1997) initiated the Mediterranean and Black Sea

regional module of GODAR. These projects were followed by a wider

EU concerted action MEDAR/MEDATLAS-II, launched in 1998 with

the overall objective to make available a comprehensive data product

of multi-disciplinary in-situ data and information in the

Mediterranean and Black Sea, through a wide co-operation of the

bordering countries. The data management was focused on basic

parameters that in?uence the biodiversity and the primary production

and for which sufficient preliminary knowledge of the distributions

were available to allow quality checks to be performed. These selected

parameters were: Temperature, Salinity, Oxygen, Phosphate, Silicate,

PH, Nitrate, Nitrite, Ammonium, Chlorophyll, Alkalinity, Total

Phosphorus, H2S, Total Nitrogen. This paper present a brief overview

of the resulting data and products and new actions in preparation to

improve the Mediterranean data servicing.

Data processing

The 17 oceanographic data centres of the MEDAR consortium have

compiled historical and recent data from 150 source laboratories of 33

countries. The integrated database has been prepared by using a

common protocol (1) for formatting the data and checking them for

quality in agreement with the international standards of ICES, IOC

and EC/MAST. Accordingly automatic (objective) and visual

(subjective) checks have been performed, which result in a quality ?ag

added to each numerical value: location, date and data points,

respectively. These checks have been performed at four Regional Data

Centres, while the Global Assembling Centre finalized quality and

duplicates checks. Several up and down transfers of subsets of data

between the data centres have been necessary before getting a fully

qualified integrated data set. The resulting volume of data has doubled

compared to 1997 database. It includes now 161 877 vertical profiles

of temperature form bathythermographs and thermistor chains and

124 002 multi-parameters profiles from CTD and bottle casts.

However the number of profiles is very variable from a parameter to

another, and besides temperature and salinity (118 009 profiles,

Fig.1), the highest numbers of available profiles are for oxygen and

phosphate (44 928 and 20 761 respectively). 

The qualified data were used to produce higher-level products

providing a more complete and synthetic view of the bio-chemical

systems. Climatological and gridded fields were computed by using

the Variational Inverse Model (2), on finite elements and then re-

interpolated on a regular grid (0.2 degrees in Latitude and Longitude),

with smaller scales for local computations. The computations were

made on a climatic, seasonal or monthly scale when the space and

time data coverage were sufficient. The gridded fields have been

mapped horizontally and vertically. On these maps the main features

of the region, such as the Atlantic in?ow and the Levantine meso-scale

eddies appear very clearly at the resolution of the computation. 

Fig. 1. Distribution of the 118 009 salinity profiles 

Present and future data services 

MEDATLAS 2002 (3) disseminated by the MEDAR network, is the

resulting database published in the form of a set of four CDRoms in

order to facilitate the access to data. It includes meta-data, observed

and gridded data, maps, vertical sections, user friendly software to

extract, visualise, plot, check for quality and process data. It is

presently the best available integrated database for the Mediterranean

and Black Seas, and a real scientific and educational tool. 

Still there are needs for getting similar possibilities on line, for

getting new data sets and products such as mean, decadal, seasonal,

monthly statistics at basin, regional and shelf scales and for

developing the quality assurance protocols for bio-chemicals and

gridded products. Therefore new projects are in preparation

(MEDBLACK-ODN and SEA-DATANET), intending to provide the

needed integrated services through the networking of national data

centers, enhanced capacity building activities and better public

awareness on the data heritage.

MEDAR Group acknowledgement with thanks the laboratories,

which contributed to the database, the organisations and EU

(contract MAS3-CT98-0174/ERBIC20-CT98-0103), which provided

the financial support for the project.

References

1-MEDAR Group, 2001. Medar-Medatlas Protocol (Version 3) Part I:

Exchange Format and Quality Checks for Observed Profiles; Rap. Int.

IFREMER/TMSI/IDM/SIS002-006, 50 P.

2-Rixen, M., Beckers, J.-M., Brankart, J.-M., and Brasseur, P., 2001. A

numerically efficient data analysis method with error map generation.

Ocean Modelling, 2(1-2): 45-60.

3-MEDAR Group, 2002. MEDAR/MEDATLAS 2001 Database.

Mediterreanean and Black Sea cuise Inventory, Observed Data, Analysed

Data and Climatological Atlas, IFREMER Ed. (4 Cdroms).