Rapp. Comm. int. Mer Médit., 37,2004
229
MODELLING THE VERTICAL BIOGEOCHEMICAL STRUCTURE OF THE BLACK SEA
Temel Oguz
Institute of Marine Sciences, Middle East Technical University, Erdemli, Turkey
Abstract
A vertically resolved, coupled physical-biogeochemical model is developed to describe the food web structure, nitrogen cycling and redox
processes taking place near the oxic-anoxic interface zone of the Black Sea. The model thus provides a unified representation of dynamically cou-
pled oxic-suboxic-anoxic system which allows to simulate a realistic yearly succession of diatom, dino?agellate, Emiliania huxleyi blooms, as well
as basic features of the suboxic zone dynamics, and the way in which it is controlled by upward and downward material ?uxes from the interior
of the anoxic layer and chemocline zone of the surface layer, respectively. 
Key words: Black Sea, phytoplankton blooms, suboxic zone, redox reactions, modeling
The major processes controlling the food web structure, recycling
of nutrients, and oxidation/reduction reactions taking place nears the
anoxic interface of the Black Sea is studied by a coupled physical-bio-
geochemical model. It relates the annual cycle of plankton production
in the form of a series of successive phytoplankton, mesozooplankton
blooms to organic matter generation and to the remineralization-
ammonification-nitrification-denitrification chain of the nitrogen
cycle as well as to anaerobic sulfide oxidation through a series of reac-
tions catalyzed by dissolved and particulate manganese. 
The ecosystem model includes three most dominant phytoplankton
taxonomic groups in the Black Sea comprising Bacillariophyta
(diatoms, P
d
), Dinophyta (dino?agellate, P
f
), Chrysophyta (coccol-
ithophore E. huxleyi, P
e
). The fourth group comprises small phyto-
plankton community (P
s
) representing phytoflagellates and
picopyhtoplankton. The zooplankton community is represented by
microzooplankton (Z
s
), and mesozooplankton (Z
l
) groups. They con-
sume different phytoplankton groups with different preferences, as
specified in their grazing terms. All plankton biomass are expressed in
nitrogen units; nitrogen is considered to be the most important limit-
ing nutrient for the interior Black Sea ecosystem. Silicate and phos-
phate are abundant elements in the Black Sea with respect to total
dissolved inorganic nitrogen even though their anthropogenic suppy
have been reduced in 1990s after the dam constructions along the
River Danube; thus, silicate and phosphorus do not limit diatom and
E. huxleyiproductions, respectively. Even though E. huxleyiare
grown in the Black Sea under nitrogen limited conditions, the model
is supported by a simplified phosphorus cycle in order to explore its
competitiveness under phosphorus limitation. The simplified nitrogen
and phosphorus cycles involve labile pelagic detrital nitrogen (D
n
)
and phosphorus (D
p
), as well as dissolved inorganic nitrate (N
n
),
ammonium (N
a
), and phosphate (N
p
). In addition, the model includes
attached and detached coccolith concentrations as two additional
prognostic variables. 
The annual phytoplankton community structure simulated by the
model involves a diatom-based bloom during the late winter-early
spring period. It is strongest bloom of the year and followed by a
series of successive other bloom events mainly dominated by subsur-
face summer productions of dino?agellates, and subsequently a weak-
er, mixed assemblage of diatom and dino?agellate community
development in autumn months. They are robust features of the annu-
al phytoplankton structure, and appear as distint signals in the month-
ly composite chlorophyll data. The signature of the intense late winter
diatom bloom is high chlorophyll concentration of more than 2 mg 
m
-3
distributed uniformly over the 40-50 m thick euphotic zone. The
autumn bloom is less intense and relatively shallower characterized by
chlorophyll concentrations of around 1 mg m
-3
within the surface
mixed layer of 25-30 m. These two blooms are linked to the weaker
summer subsurface bloom confined at deeper part of the euphotic
zone below the seasonal thermocline. It is characterized by chloro-
phyll concentrations in the range of 0.3-to-1.0 mg m
-3
. The simula-
tions have further suggested E. huxleyias yet another essential
element of the annual phytoplankton community structure during
summer months within the shallow surface mixed layer. The summer
E. huxleyibloom typically initiates during mid-May, attains its
strongest phase throughout June, and finally terminates by mid-July. 
Almost continuous particulate organic matter production associat-
ed with the year-long biological activity supports an efficient nitrogen
cycling within approximately the upper 75 m of the water column,
where dissolved oxygen generated photosynthetically and by air-sea
interactions is depleted due to consumption during aerobic particulate
matter decomposition. The layer below could not be ventilated even
for the conditions of exceptionally high winter cooling due to the
presence of a strong density stratification. Even with a highly simpli-
fied representation of the redox processes, the model provided a
quasi-steady state suboxic-anoxic interface zone structure similar to
observations. It was able to give quantitative evidence for the presence
of an oxygen depleted and non-sulfidic suboxic. This model pointed
out the crucial role of the downward supply of nitrate from the over-
lying nitracline zone and the upward transport of dissolved man-
ganese from the anoxic pool below for maintenance of the suboxic
layer. The model is also used to test the assumption of isopycnal
homogeneity of the SOL properties and their independence from the
circulation features, as asserted previously. It is found that the SOL
properties do not possess isopycnal uniformity throughout the basin,
and vary depending on the intensity of vertical diffusive and advective
oxygen ?uxes across the oxycline. Anticyclones, with downwelling
and downward diffusion (i.e, with stronger net downward supply of
oxygen), attain a thinner suboxic layer at a deeper part of the water
column relative to cyclones. The position of the upper boundary of the
SOL changes from 
s
t~15.6 kg m
-3
in cyclonic to 15.9 kg m
-3
in anti-
cyclonic regions, whereas its position in the peripheral Rim Current
transition zone occurs at intermediate density values. Re-analysis of
the existing data provides firm evidence for such differences.