190
Twenty-five bacterial strains isolated from Venice Lagoon and able to
degraden-alkanes,n-alkanols,n-alkanals and n-alkanoates, were previ-
ously characterized at the molecular and physiological level (1, 2). Only
strains belonging to the new species A. venetianusgrew in minimal medi-
um containing n-alkanes (C
10
, C
14
, and C
20
) (2) and their respective oxi-
dation products as the sole carbon and energy source. The other strains
thrived on n-alkane oxidation products, giving rise to a sort of "functional
complementation", in that single members of the community perform dif-
ferent step(s) of the degradation process. The A. venetianusVE-C3 cells
initiate diesel fuel degradation by oxidizing n-alkanes, providing organic
residues suitable for the other bacteria of the community.
The analysis of plasmid content revealed that A. venetianusVE-C3 cells
harboured two plasmid molecules, pAV1 and pAV2, of 10Kb and 15Kb,
respectively. Hybridization experiments also showed that pAV2 contained
sequences homologous to the Pseudomonas oleovoransalkBFGH genes.
TheA. venetianusVE-C3 cells were able to degrade diesel fuel by a
mechanism requiring the formation of cell aggregates and their further
adhesion to diesel fuel drops, via the synthesis of a polysaccharide capsule
(3). This process was studied in A. venetianusmutants, obtained through
the conjugal transfer of pRK290, a 20 kb broad-host range plasmid, from
Escherichia colito VE-C312 (a spontaneous Rif
r
mutant) cells. Most of ex-
conjugants showed large rearrangements in plasmid profile, mainly con-
sisting in loss of plasmid pAV1 (such as in mutant C312/3); other mutants
showed a molecular rearrangement of this plasmid (mutant C312/30).
Mutants C312/3 and C312/30 were further characterized at physiological
and molecular level; they showed a reduced ability to grow in the presence
of diesel fuel or hexadecane as the sole carbon and energy source. This was
probably due to a reduced ability of aggregation and the further adhesion
to hydrocarbons, as shown in figure 1. Moreover in cell-to-surface adhe-
sion experiments, performed by MATH test, VE-C3 and VE-C312 cells
appeared to be hydrophilic when grown in a complex medium but became
hydrophobic when incubated in mineral medium with diesel fuel as the
sole carbon and energy source (not shown). The same test, carried out on
mutants C312/3 and C312/30, showed that both of them were always
hydrophobic, even when grown in a complex medium without diesel. The
mutant phenotype could be due to the loss (or mutation) of genes (very
likely located on plasmid pAV1) encoding proteins involved in cell to cell
aggregation and that might be localized on cell envelope.To check this
hypothesis, membrane proteins were extracted from VE-C3 cells grown in
the complex medium and in the mineral medium with diesel fuel as sole
carbon and energy source. PAGE analysis of these proteins showed the
presence of a 23.8 KDa protein only in A. venetianus VE-C3 cells grown
in the presence of diesel fuel. This protein was absent in cell extracts of
VE-C3 cells grown in the absence of hydrocarbons. The 23.8 KDa protein
is induced by hydrocarbons and is probably involved in adhesion of bacte-
ria to hydrocarbons. Studies are in progress in order to understand the role
of the protein in the cell adhesion to hydrocarbon process.
The study of hydrocarbon degradation in A. venetiuanus VE-C3 was
also carried out by cloning of alk genes. For this purpose polymerase chain
reaction (PCR) experiments were carried out in order to amplify alk
sequences from both VE-C3 chromosome and plasmids. PCR reactions
were performed using two primers previously designed for the amplifica-
tion of alk sequences from different microorganisms.We obtained the
amplification of a 600-bp DNA fragment from the VE-C3 chromosome,
whose nucleotide sequence was determined. The comparative analysis of
this sequence with those available in databases revealed that it shared a
high degree of sequence similarity with alkM genes from different hydro-
carbon-degrading bacteria. This suggested that, at least some genes
involved in diesel fuel degradation in A. venetianus are located on the bac-
terial chromosome. Studies of this gene, as well as the nucleotide sequenc-
ing of plasmids pAV1 and pAV2, are in progress.
References
1. Baldi F, Pepi M, Fani R, Di Cello F, Da Ros L and Fossato VU (1997).
Complementary degradation of n-paraffins by aerobic Gram-negative
bacteria isolated from Venice Lagoon. Croatica Chemica Acta, 70(1):
333-346.
2. Di Cello F, Pepi M, Baldi F and Fani R (1997) Molecular
characterization of an n-alkanre degrading bacterial community.Research
in Microbiology, 148: 237-249.
3. Baldi F, Ivosevic N, Minacci A, Pepi M, Fani R, Svetlicic V and Zutic
V(1998) Adhesion of encapsulated Acinetobacter venetianusto fuel-oil
droplets studied by in situelectrochemical and molecular probes. Appl
Environ Microbiol, 65(5): 2041-2048.
Rapp. Comm. int. Mer Médit., 36,2001
DIESEL FUEL DEGRADATION  : PHYSIOLOGICAL AND MOLECULAR CHARACTERIZATON OF
ACINETOBACTER VENETIANUS STRAINS ISOLATED FROM VENICE LAGOON
S. Grazzini
1
, L. Cioni
1
, M. Innocenti
1
, R. Cecchi
1
, F. Baldi
2
, M. Pepi
2
and R. Fani
1
*
1
Dipartimento di biologia animale e genetica, Università degli Studi, Firenze, Italy - r_fani@dbag. unifi.it
2
Dipartimento di Scienze ambientali, Venezia, Italy 
Abstract
The bacterial strain VE-C3, belonging to the new species Acinetobacter venetianus, isolated from Venice Lagoon and involved in diesel
fuel degradation, was characterized by a combination of molecular and physiological techniques. A. venetianusVE-C3 cells were able to
grow in the presence of n-hydrocarbons by forming cell aggregates which adhere to hydrocarbon drops. A 23.8 KDa protein appeared to
be involved in the formation of cell aggregates. The oxidation of n-hydrocarbons was carried out by Alk proteins homologous to the
Pseudomonas oleovorans alkBFGH gene products and whose genes were located on the VE-C3 chromosome and in plasmid pAV2.
Keywords: diesel fuel, Acinetobacter venetianus, alk genes
Figure 1. Analysis of cell aggregation of A. venetianusstrains
grown on diesel fuel (A-D) or on n-hexadecane (E-H). (A, E) A.
venetianusVE-C3; (B, F) A. venetianusC312; (C, G) A. vene-
tianusC312/3; (D, H) A. venetianus C312/30.